Институт стран СНГ (Институт диаспоры и интеграции) был создан 11 апреля 1996 году в форме автономной некоммерческой организации. Среди учредителей Института: МГУ им. М.В. Ломоносова, МГИМО МИД РФ, институты Российской академии наук (славяноведения; этнологии и антропологии; Европы).
С момента основания Института в круг его задач входит изучение постсоветского пространства, научно-аналитическое и общественно-политическое сопровождение внешнеполитической деятельности Российской Федерации в ближнем зарубежье, а также российской диаспоральной политики, мониторинг и прогнозирование внутренней и внешней политики бывших союзных республик, анализ моделей экономической, политической, военной и культурной интеграции на постсоветском пространстве. Большое значение Институт уделяет сбору и обработке информации о положении соотечественников в ближнем зарубежье, укреплению связей с российской диаспорой за рубежом. Одно из приоритетных направлений деятельности Института — мониторинг этно-социальных и военно-политических конфликтов на территории бывшего СССР, выработка рекомендаций по их разрешению и предотвращению.
До сих пор Институт является единственным российским научным учреждением, обеспечивающим всестороннее и комплексное исследование социально-политических и экономических процессов на постсоветском пространстве и проблем российских соотечественников.
В число основных пользователей информационно-аналитических докладов, исследований и прогнозов Института входят: Государственная Дума и Совет Федерации РФ, МИД РФ, Совет безопасности РФ, Администрация Президента РФ, Министерство культуры РФ, Минэкономразвития РФ, исследовательские центры Российской академии наук, неакадемические государственные институты, аналитические центры, крупные бизнес-структуры, имеющие интересы на постсоветском пространстве.
Структура Института в полной мере отражает специфику и направления его деятельности. В Институте работают отделы: Украины, Белоруссии, Кавказа, Молдовы и Приднестровья, Средней Азии и Казахстана, Диаспоры и миграции, Евразийских исследований и ШОС, Отдел по связям с РПЦ и православным сообществом за рубежом, Исламских исследований, Сравнительного законодательства, Экономических исследований.
В организационной структуре Института стран СНГ действует Правовой центр, который оказывает бесплатную юридическую помощь соотечественникам, проживающим за рубежом, а также прибывшим в Россию на постоянное жительство и столкнувшимся с нарушением своих прав, нуждающимся в консультации по вопросам легализации в стране или различным жизненным ситуациям.
Институт имеет представительства и партнерские организации в Ереване, Севастополе, Тирасполе, Минске, Белграде.
В 2019 году в структуре Института был создан Научно-образовательный центр (НОЦ) – Центр дополнительного образования и переподготовки кадров.
За годы своего существования, с 1996 года Институт стран СНГ провел более 200 конференций и круглых столов с привлечением экспертов мирового уровня. Только за последние два года Институт организовал более 30 научно-практических конференций, 8 из которых носили статус международных.
Со времени 20-летнего юбилея, который отмечался в 2016 году, Институт провел десятки мероприятий самого разного уровня. Так рядом знаковых мероприятий был ознаменован и 2016 год. В апреле 2016 года в Сочи состоялся Международный форум «На втором треке. Роль гражданского общества и общественной дипломатии в дальнейшем развитии и расширении Шанхайской организации сотрудничества». Организатором представительного мероприятия выступила Общественная палата Российской Федерации совместно с Институтом стран СНГ. Ответственным секретарем Форума был руководитель Рабочей группы Общественной палаты РФ по евразийской интеграции и развитию ШОС, директор Института стран СНГ Константин Затулин.
В 2016 году в Институте стран СНГ состоялся ряд Круглых столов, в том числе: «330-летие присоединения Киевской митрополии к Московскому Патриархату и актуальные проблемы сохранения единства Русской Православной Церкви», посвященный 330-летию присоединения Киевской митрополии к Московскому Патриархату; «Президентские выборы в Молдове: особенности, вероятные сценарии, прогноз дальнейшего развития республики»; «Итоги саммита ШОС в Узбекистане», «Проблема Русского мира в восприятии элит Белоруссии».
В 2017 году прошел ряд Круглых столов и научно-практических конференций, посвященных: годовщине Переяславской Рады, перспективам развития Молдовы и Приднестровья после президентских выборов, развертыванию сил НАТО в постсоветской Прибалтике, а также Круглый стол в преддверии саммита Шанхайской организации сотрудничества в Астане; «Осетия и регион: проблемы и тенденции»; «Интеграционные векторы и дилеммы: детерминанты и вызовы для Армении» и другие.
Знаковое событие — семинар на тему «Проблемы текущего состояния и развития Шанхайской организации сотрудничества» сосоялось в феврале 2018 года. Семинар прошел при участии свыше тридцати экспертов из Института востоковедения РАН, Института Дальнего Востока РАН, Института мировой экономики и международных отношений им. Е.М. Примакова РАН, Российского института стратегических исследований, Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Московского государственного института международных отношений МИД РФ, Национального исследовательского университета «МЭИ» (Московский энергетический институт), Российского университета дружбы народов им. П. Лумумбы, Российского государственного гуманитарного университета и ряда общественных организаций.
В марте 2018 года прошел семинар «Внутриполитическая ситуация в Республике Армения после президентских выборов». Целью мероприятия являлся анализ политической ситуации в Армении и обсуждение итогов президентских выборов, состоявшихся 2 марта, и перспектив российско-армянских отношений.
10 сентября 2019 года в Институте стран СНГ состоялось первое заседание инициативной группы по созданию Расулевского клуба имени суфийского духовного наставника мусульман постсоветского пространства Зейнуллы Расулева. В состав Совета Расулевского клуба вошли первый заместитель директора Института стран СНГ, доктор исторических наук, доктор экономических наук, профессор Владимир Егоров, заместитель директора Института культурного и природного наследия им. Д.С. Лихачева, кандидат филологических наук Евгений Бахревский, а также Кирилл Фролов, Эльвина Ягнакова, Анна Беликова, Ильдар Сафаргалеев (председатель организационного комитета) и правнучка Великого Шейха Зейнуллы ишана Нелюфарь Расулева.
Ряд международных мероприятий был организован Институтом стран СНГ в 2020 году. В мае 2020 года состоялась Международная научно-практическая конференция «Всемирное историческое значение победы советского народа в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг». Организаторами выступили: Тираспольский филиал Института стран СНГ, Российский центр науки и культуры в Кишиневе, Институт социально-политических исследований и регионального развития и Союз русских общин Приднестровья.
В мае того же года состоялась Международная научно-практическая конференция «Память о Второй Мировой войне и современная геополитика».
А в октябре 2020 года на базе Института стран СНГ прошла международная научно-практическая конференция «Центральная Азия: актуальные вызовы». В качестве ее соорганизаторов выступили Российский университет транспорта (МИИТ), Российский университет дружбы народов (РУДН) и Международный центр изучения Евразии.
На круглом столе, посвященном президентским выборам в Молдове, который состоялся 14 октября 2020 года, рассматривались вопросы соотношения политических сил в ходе президентской кампании в Молдове, вероятные итоги выборов, влияние президентской кампании на ситуацию в Приднестровье, возможен ли «белорусский вариант» в Молдове и другие.
Специальный представитель Госдумы РФ по вопросам миграции и гражданства, Первый заместитель Председателя Комитета Госдумы РФ по делам СНГ, евразийской интеграции и связям с соотечественниками, Руководитель Института стран СНГ, член Правительственной комиссии по делам соотечественников за рубежом, член Правительственной комиссии по миграционной политике Константин Затулин 19-20 ноября 2020 года принял участие и выступил с докладом на III Международной научно-практической конференции «Миграция и глобальные вызовы третьего десятилетия» при экспертной поддержке Совета Европы и Управления Верховного комиссара ООН по делам беженцев.
9 декабря 2020 года состоялась Международная научно-практическая конференция «Иммиграционная амнистия как механизм решения демографических проблем в России». На мероприятии были рассмотрены актуальные проблемы, связанные с демографическими угрозами национальной безопасности, легализацией длительно проживающих в России иностранных граждан лиц с неурегулированным правовым статусом, включая трудовых мигрантов, в том числе, в условиях пандемии, а также особенностями миграционных амнистий и опытом их проведения в разных странах. Конференция была посвящена памяти Лидии Ивановны Графовой, известного журналиста-правозащитника, лауреата премии «Золотое перо России», четверть века руководившей «Форумом переселенческих организаций». Организаторами вместе с Институтом стран СНГ выступило Международное общественное движение «Форум переселенческих организаций», Институт демографических исследований (ИДИ) ФНИСЦ РАН. В работе конференции приняла участие руководитель Главного управления по вопросам миграции МВД России В.Л. Казакова, представители профильных министерств и ведомств, эксперты, специалисты и адвокаты в сфере миграции. Итогом этой важнейшей конференции стала Резолюция с «Предложениями по проведению миграционной амнистии и легализации мигрантов», которые были направлены для дальнейшей совместной проработки в Администрацию Президента Российской Федерации, Совет Федерации, Государственную Думу, МВД России, МИД России, Минюст России, Минтруд России и Правительственную комиссию по миграционной политике.
Завершился 2020 год научно-практической конференцией, посвященной 225-летию освобождения Белоруссии от польского ига. Организаторами конференции вместе с Институтом стран СНГ стали Международная славянская академия, Институт государства и права РАН, РВИО.
Сегодня в составе Института работает 64 сотрудника, среди которых 6 докторов и 12 кандидатов наук. Результаты научной и информационной деятельности Института находят отражение на страницах выпускаемых им периодических изданий: «Украина: информационно-аналитический мониторинг», «Молдово-Приднестровский регион», «Постсоветский материк», «Обозреватель — Observer», «Геоэкономика энергетики». Последние три включены в перечень изданий, рекомендованных ВАК РФ к публикации статей по результатам диссертационных исследований.
Институт стран СНГ сотрудничает с ведущими отечественными общественно-политическими структурами, работающими в рамках профильной проблематики: Фондом «Русский мир», Фондом поддержки публичной дипломатии им. А.М. Горчакова, Фондом поддержки и защиты прав соотечественников, проживающих за рубежом, Фондом «Историческая память» и др.